洁净室处于药厂生产核心地位，其洁净效果直接影响药品的质量。洁净室的坏境若受到污染，那么药品治疗就难以保证，这样的药品就会延误或者加剧患者的病情，给患者带给巨大身体的危害和不良的社会效应，因此保证制药洁净室的洁净是药企关注的焦点。

洁净室的清洁程度直接关系到产品车间的质量问题，所以在做洁净室、无尘车间、净化车间的清洁时一家要多考虑多个方面。制药企业需要严密加强人员管理，严格控制人流物流，合理布局空间与面积等以保证制药洁净室的洁净度。

另外，提高设备的技术水平也是保证洁净室的有力方面。据悉，洁净室设备的材质、加工精度、密闭程度以及管理制度都与交叉污染有关。因此提高设备的自动化水平，以减少操作人员，是防止交叉污染的必要措施。有行业人士表示，无菌隔离系统是完全密封的，将药品、生物制品控制、并处理成无菌状态。采用隔离操作技术可最大限度的防止产品受到污染，保护操作者的安全，避免受到毒性物质的伤害。